Lallier Sylvain
Doctorant en sociologie, Université Paris Cité
Ecole doctorale : 623 - Savoirs, Sciences, Education
Contact : sjp.lallier(at)gmail.com
Titre de la thèse : Emergence scientifique des microbiotes et transversalité de la technologie métagénomique en santé humaine et végétale
Sous la direction de Catherine Bourgain et Elise Demeulenaere
Depuis les années 2000, les études du microbiote, à l’interface entre questions de santé humaine et questions environnementales, sont source de nouvelles interventions médicales et agronomiques. Actuellement, l’intérêt pour cette diversité microbienne s’inscrit pleinement dans les plans stratégiques d’innovation à horizon 2025 et 2030 portés par l’Institut national de la santé et de la recherche médicale (Inserm) et par l’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (Inrae). En parallèle, le développement des technologies de séquençage à haut débit des génomes, associées aux nouveaux outils de bioinformatique, autorise le développement d’une approche dite « métagénomique », permettant d’analyser la diversité microbienne à l’échelle des écosystèmes microbiens.
Cette thèse a pour objectif d’analyser dans différents domaines de la santé humaine et végétale la circulation des savoirs sur les microbiotes et les conditions de déploiement et d’intégration aux approches cliniques et agronomiques des technologies de séquençage à haut débit des génomes.
Deux enjeux structurent cette thèse :
(1) documenter de façon comparative la mise à l’agenda scientifique du microbiote et ses effets au sein de champs scientifiques distincts, relevant de la santé humaine et végétale ;
(2) interroger l’articulation entre construction de l’objet de recherche "microbiote" et développement des technologies de séquençage à haut débit des génomes, ce qui suppose d’analyser le déploiement des infrastructures de recherche de ces nouvelles technologies et les dynamiques de recherche qu’elles suscitent au sein des communautés épistémiques concernées.
